常见的副作用包括皮肤干燥、粘膜炎和肝酶升高，这些通常可以通过支持性护理和剂量调整来控制。更严重的副作用，尽管不太常见，可包括高脂血症、胰腺炎和白细胞增多。因为他米巴罗汀会升高甘油三酯水平，所以通常通过定期血液检查来监控患者，以控制这种风险。在某些情况下，降脂药物可能会与他米巴罗汀联合使用，以减轻这种副作用。