白血病分子诊断是指通过分子生物学技术检测样品中的生物大分子从而诊断白血病。白血病的发生与特异性染色体异常和基因改变有关,白血病分子诊断也已广泛地应用于临床,并为疾病发现、治疗、预后、发现微小残留病变提供参考。
1.融合基因及重排的检测
(1)BCR-ABL融合基因 此基因见于95%的
慢性粒细胞白血病(CML)、25%~40%的
成人急性淋巴细胞白血病(ALL)和4%~6%的儿童ALL。费城染色体(Ph染色体)即为此融合基因的一种,是CML的重要标志,ALL患者如出现Ph阳性则提示预后较差。BCR-ABL融合基因常用
荧光原位杂交(FISH)和荧光定量聚合酶链式反应(FQPCR)进行检测。
(2)PML-RARα融合基因 此基因见于
急性早幼粒细胞白血病(APL),常用的检测方法为FISH、FQPCR、实时PCR(RT-PCR)。
(3)Ig/TCR基因重排 IgH、TCRδ、TCRγ、TCRβ是ALL常见的基因重排,急性B
淋巴细胞白血病(B-ALL)患者发生率依次为95%、94%、55%、33%,急性T淋巴细胞白血病(T-ALL)患者发生率依次为14%、68%、91%、89%。不同患者基因重排序列不同,可作为分子标志用于分型诊断。主要的检测方法有PCR。
2.基因突变及异常表达的检测
(1)C-KIT基因突变 此基因突变常出现于核心结合因子相关的急性髓性白血病(AML)(CBF-AML)中,是其预后的重要指标,也是药物治疗的重要靶点。可用多种方法进行检测,DNA测序为最直接和最准确的方法。
(2)NPM基因突变 此基因突变见于AML的多种亚型,可作为无染色体易位的AML标志。常用PCR、基因测序等方法进行检测。
(3)NOTCH1基因突变 此基因突变存在于50%的T-ALL患者中,也是T-ALL最常见的活化癌基因,有次基因突变的成人T-ALL患者预后较差。常用PCR和直接测序法进行检测。
(4)FLT3基因突变 此基因突变是AML中最普遍的突变靶基因,60岁以下患者中有此基因突变则预后较差。此基因突变也是治疗的靶点。可用毛细管电泳(CE)、PCR、高分辨率溶解曲线(HRM)、直接测序、变性聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)等方法进行检测。
(5)N-RAS基因突变 此基因突变存在于11%~30%的AML患者中,在骨髓异常综合征(MDS)患者中出现率为20%~30%,而MDS发展为
急性白血病后此基因突变率高达50%~60%。常用PCR和荧光原位杂交等进行检测。
(6)HOX11基因表达异常 此表达异常见于7%的T-ALL患者,有此表达异常的患者化疗效果好,预后亦较其他T-ALL患者好。可通过荧光定量PCR检测表达产物水平。
(7)WT1基因表达异常 多数白血病患者均有此表达异常,其表达及表达水平是急性白血病独立的预后因子,也是不伴有特异性分子异常的AML微小残留白血病(MRD)的理想检测指标。
常见的分子诊断主要步骤包括核酸提取、目的基因序列扩增、产物检测(凝胶电泳等)。针对不同的突变基因,其引物及探针序列亦不相同。
大部分白血病都存在染色体易位,染色体易位是其诊断的重要指标。白血病分子诊断已广泛应用于白血病的临床诊断中,不仅具有特异性强、快速的优势,更可从病因上进行明确诊断,并进行分型,同时通过检测相关突变位点或表达产物可为治疗、预后及治疗效果提供参考。
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